Zagrożenia i ochrona IUCN uznaje ocelota andyjskiego za gatunek zagrożony wyginięciem. Pierwszą ocenę opublikowano w 1982, uznając ocelota andyjskiego za gatunek rzadki, co następnie powtarzano w kolejnych ocenach w 1986, 1988 i 1990 (wtedy jeszcze jako gatunek kota). W 1994 wskazano brak wystarczających informacji, umieszczając zwierzę w odrębnym rodzaju. 2 lata później gatunek uznano za narażony na wyginięcie, a w 2002 za zagrożony wyginięciem. W 2008 i 2016 powtórzono ocenę zagrożenia, klasyfikując gatunek w rodzaju ocelot, co zachowano w ocenie z 2024. Ocenę taką uzasadniono niewielką liczebnością populacji, tym, że największa subpopulacja nie przekracza ćwierci tysiąca zwierząt, spadkiem liczebności i istotnymi zagrożeniami.
Liczebność dorosłej populacji szacuje się na 2177 kotów, wliczając osobniki młodociane 4354. Spada ona.