W 2006 r. poddano gruntownej przebudowie Kaplicę Matki Bożej Pokoju, odnowioną pod nadzorem architekta João de Sousa Araújo. W następnym roku (17 maja 2007) otwarto salę bł. papieża Jana XXIII, w której znajduje się osiem obrazów olejnych tego samego architekta inspirowane encykliką Pacem in Terris oraz grupa rzeźb przedstawiająca Anioła Portugalii (Pokoju) udzielającego komunii pastuszkom z Fatimy, również autorstwa João de Sousa Araújo. Tego samego dnia został odsłonięty Wysoki Krzyż autorstwa architekta Carlosa Freire, przeniesiony z Sanktuarium Matki Bożej Fatimskiej.
17 maja 2008 roku nastąpiło otwarcie Kaplicy Powierników Serca Jezusowego, w której znajdują się cenne relikwiarze św. Małgorzaty Marii Alacoque, św. Jana Eudesa, św. Faustyny Kowalskiej i Marii od Boskiego Serca Jezusa, a także Dziesięć Przykazań z brązu, flankujące portal wejściowy do pomnika.
11 maja 2010 r., podczas podróży apostolskiej do Portugalii, Papież Benedykt XVI przeleciał nad pomnikiem, a po Mszy Św. na placu Handlowym (Praça do Comércio), odczytał przesłanie na zakończenie obchodów 50. rocznicy powstania sanktuarium Chrystusa Króla.