Za osiągnięcia naukowe, dydaktyczne i organizacyjne uhonorowana Złotym Krzyżem Zasługi (1973), Krzyżem Kawalerskim Orderu Odrodzenia Polski (1980), Medalem Komisji Edukacji Narodowej, Nagrodą Ministra Edukacji (1967, 1971) i Ministra Ochrony Środowiska, Zasobów Naturalnych i Leśnictwa (1995). Odznaczona Medalami Polskiego Towarzystwa Botanicznego, im.: Bronisława Hryniewieckiego (1998) i Zygmunta Czubińskiego (2004). W dowód uznania za wkład w rozwoju nauk biologicznych na Uniwersytecie Gdańskim, Wydział Biologii UG uhonorował ją Medalem im. Jacoba Theodora Kleina (2012). Członkini honorowa (od 1974) i Polskiego Towarzystwa Botanicznego (od 1995). W 1998 w siedzibie Wolińskiego Parku Narodowego odbyła się uroczyste zasadzenie dębu im. Profesor Hanny Piotrowskiej, jako symbolu pamięci zasług dla tego Parku.
Zmarła 26 lipca 2015. Pochowana na cmentarzu Srebrzysko w Gdańsku (rejon III, taras I)