Publikacje Aleksander Kośko jest autorem lub współautorem ponad 20 monografii naukowych. Wśród jego najważniejszych prac znajdują się:
Rozwój kulturowy społeczeństw Kujaw w okresach schyłkowego neolitu i wczesnej epoki brązu (1979) Udział południowo-wschodnioeuropejskich wzorców kulturowych w rozwoju niżowych społeczeństw kultury pucharów lejkowatych (1981) Osady kultury pucharów lejkowatych w Inowrocławiu-Mątwach, woj. Bydgoszcz (1988) Ze studiów nad kujawską enklawą naddunajskiej cywilizacji wczesnobrązowej (1991) Z badań nad genezą, rozwojem i systematyką kultury pucharów lejkowatych na Kujawach (1993, współautor: Lucyna Czerniak) Opatowice-Wzgórze Prokopiaka. Seria: Studia i materiały do badań nad późnym neolitem Wysoczyzny Kujawskiej (2006–2015, współautor: Magdalena Szmyt, 5 tomów)