W styczniu 2001 roku rada Sound Transit przyjęła nowy budżet i harmonogram, w tym postanowienie o ponownym przeanalizowaniu wariantów trasy na odcinku między centrum Seattle a dzielnicą uniwersytecką. Jednocześnie podpisano z rządem federalnym umowę na dotację w wysokości 500 milionów dolarów przeznaczoną na budowę „segmentu początkowego”. W tym samym roku Sound Transit zatwierdziło skróconą wersję tego segmentu – liczącą 23 km linię z centrum Seattle do stacji (w pobliżu lotniska Sea-Tac). Odcinki do samego lotniska oraz do dzielnicy uniwersyteckiej zostały przełożone do ponownego etapu planowania i ostatecznie przekształcone w odrębne projekty rozbudowy kolei miejskiej.
W listopadzie 2001 roku rada Sound Transit zatwierdziła budowę skróconego projektu Central Link, zakładając rozpoczęcie robót latem 2002 roku. W marcu 2002 roku rozpoczęto wykup gruntów w Rainier Valley, jednak start właściwych prac budowlanych opóźniły dwa procesy sądowe. W listopadzie 2002 roku Sąd Najwyższy hrabstwa King oddalił pozew przeciwników kolei miejskiej, którzy kwestionowali uprawnienia Sound Transit do skrócenia trasy zatwierdzonej wcześniej w referendum. Kolejny problem pojawił się wraz z przyjęciem Inicjatywy 776 , która przewidywała zniesienie podatku od pojazdów silnikowych – jednego z głównych źródeł finansowania Sound Transit.