Rozgrywka Frostpunk 2 jest strategiczną grą o przetrwaniu społeczeństwa, która rozwija mechaniki znane z pierwszej części, przenosząc ciężar rozgrywki z zarządzania w skali mikro na skalę makro. W przeciwieństwie do pierwowzoru, w którym gracz zarządzał pojedynczymi budynkami i godzinowym harmonogramem pracy, sequel operuje na poziomie całych dzielnic oraz tygodni, które mijają w ciągu sekund. Podstawą rozgrywki jest rozbudowa metropolii na heksagonalnej siatce, co wymaga wcześniejszego przygotowania terenu poprzez mechanikę lodołamania, czyli wysyłania ekspedycji w celu oczyszczenia zamarzniętej ziemi pod przyszłe inwestycje.
Gracz wznosi wyspecjalizowane dzielnice (m.in. mieszkalne, wydobywcze, produkcyjne czy logistyczne), które zajmują wiele pól i mogą być ulepszane o dodatkowe budynki zapewniające specyficzne bonusy. Kluczowym aspektem planowania przestrzennego jest system synergii i sąsiedztwa. Nieodpowiednie rozmieszczenie stref, np. budowa osiedli w pobliżu przemysłu, prowadzi do wzrostu zanieczyszczenia i spadku zdrowia mieszkańców. Gospodarka gry ewoluowała z oparcia na węglu w stronę ropy naftowej, choć gracz musi zarządzać również innymi zasobami, takimi jak żywność, materiały, prefabrykaty czy siła robocza.