Po kapitulacji załogi miasta w dniu 22 września 1939 roku, zaangażował się w opiekę nad ludnością cywilną.

Został aresztowany przez NKWD w połowie listopada 1939 rokuBiogram na stronie Encyklopedii Powiatu Działdowskiego podaje, że został aresztowany w październiku 1939 roku.. Okoliczności jego śmierci pozostają niejasne. Według niektórych źródeł został zamordowany we Lwowie. Według niektórych badaczy, został osadzony w obozie jenieckim w Kozielsku i wywieziony stamtąd wraz z innymi kapelanami 23 grudnia 1939 (Zbrodnia katyńska).

Historyk Mečislav Borák podawał, że przez długi czas błędnie uważano, że jako oficer został wywieziony do Kozielska, a fakt, iż jego ciała nie znaleziono w Katyniu, tłumaczono przypuszczeniem, że mógł być z obozu wywieziony w czasie Świąt Bożego Narodzenia i zamordowany w innym miejscu.