Adhezja może też inicjować tworzenie biofilmu, w którym komórki drobnoustrojów są zanurzone w macierzy substancji pozakomórkowych; taka struktura sprzyja przetrwaniu patogenu (m.in. przez ograniczenie działania mechanizmów odpornościowych i obniżenie wrażliwości na leki przeciwdrobnoustrojowe), co wiąże się z trudnościami terapeutycznymi i skłonnością zakażeń związanych z biofilmem do nawrotów.
Kandydoza przełyku może współistnieć z kandydozą jamy ustnej; w badaniach opisywano wysoki odsetek współwystępowania (około 2/3 chorych). Może ona także występować w przebiegu uogólnionych postaci zakażeń grzybiczych u osób ze znacznym upośledzeniem odporności.
Czynniki ryzyka Do najważniejszych czynników ryzyka rozwoju kandydozy przełyku należą m.in.: niedobory odporności komórkowej (zwłaszcza w przebiegu zakażenia HIV i AIDS) leczenie immunosupresyjne (m.in.