Statut przewiduje także członkostwo emerytowane.
Liczba członków zwyczajnych nie może przekraczać 111. Liczba członków zagranicznych i emerytowanych nie jest statutowo ograniczona. Na stronie towarzystwa podano, że funkcjonują kategorie członków zwyczajnych, zagranicznych, emerytowanych oraz zmarłych członków.
Władze Organem wykonawczym towarzystwa jest rada. W kadencji od maja 2024 do maja 2026 prezesem Učené společnosti České republiky jest Martin Loebl, pierwszym wiceprezesem Ivo Starý, drugim wiceprezesem Libor Grubhoffer, a sekretarzem naukowym Šárka Nečasová.
Nagrody i medale Towarzystwo przyznaje Medal Učené společnosti České republiky za zasługi dla rozwoju nauki. Medal może zostać przyznany również pośmiertnie; jego nadanie nie wiąże się z nagrodą pieniężną.
Učená společnost České republiky przyznaje także nagrody za wyniki naukowe, nagrody dla młodych badaczy, studentów szkół wyższych, uczniów szkół średnich oraz nauczycieli. Nagrody są przeznaczone dla osób będących obywatelami Republiki Czeskiej, pracujących w Czechach i niebędących członkami towarzystwa.