W latach 1975–1989 pełnił stanowisko Dyrektora Instytutu Inżynierii Chemicznej i Budowy Aparatury Politechniki Śląskiej. Od 1970 r. wiceprzewodniczący Zarządu Uczelnianego TPPR.
Był także członkiem wielu prestiżowych organizacji, m.in. Rady Naukowej Instytutu Aparatury Przemysłowej I Energetyki Politechniki Krakowskiej (1973–1981), Rady Naukowej Instytutu Technologii Chemicznej Politechniki Poznańskiej (1975–1980), Rady Techniczno-Ekonomicznej Zjednoczenia Aparatury Chemicznej w Gliwicach (1976–1980), Komitetu Naukowego Inżynierii Chemicznej PAN (1975–1981), Komitetu Inżynierii Środowiska PAN (1981–1983), Stowarzyszenia Inżynierów i Techników Przemysłu Chemicznego. W latach 1986–1989 pełnił też funkcję Przewodniczącego Rady Naukowej Ośrodka Badawczo Rozwojowego Maszyn dla Przetwórstwa Płodów w Pleszewie.
Zmarł w Gliwicach, pochowany na cmentarzu Centralnym (sektor D6-1-10). mały|Grób prof. Jerzego Pikonia na Cmentarzu Centralnym w Gliwicach Publikacje