4 października okręt przydzielono do 2. Flotylli U-Bootów Hochseeflotte. Do końca wojny jednostka nie uczestniczyła już w akcjach bojowych. Po zakończeniu działań wojennych, w myśl postanowień rozejmu w Compiègne, SM UB-88 został 26 listopada 1918 roku poddany aliantom. W wyniku podziału niemieckiej floty jednostka przypadła USA i była eksponowana w portach Wschodniego Wybrzeża, Zatoki Meksykańskiej, Panamy i Zachodniego Wybrzeża. Następnie U-Boot służył do testów, a 3 stycznia 1921 roku został zatopiony w jako okręt-cel ogniem artylerii niszczyciela USS „Wilkes”.
Wrak SM UB-88 został zlokalizowany i zbadany przez nurków w sierpniu 2003 roku.
Podsumowanie działalności bojowej SM UB-88 odbył pięć patroli bojowych, podczas których zatopił 14 statków o łącznej pojemności BRT i uszkodził dwa o łącznej pojemności BRT. Na pokładach zatopionych jednostek zginęło 90 osób, w tym 43 na brytyjskim parowcu „Polesley”. Pełne zestawienie osiągnięć bojowych okrętu przedstawia poniższa tabela: