Odejścia i zwolnienia W sierpniu 2020 studio opuścił jeden z założycieli, Alex Evans, który dołączył do Nvidii. W styczniu 2023 z zespołu odszedł Kareem Ettouney, a następnie Mark Healey. W kwietniu 2023 ogłoszono zakończenie wsparcia dla Dreams we wrześniu tego samego roku. W październiku 2023 pojawiły się nieoficjalne doniesienia o zwolnieniach w studiu, które miały objąć od 15 do 20 procent pracowników. Studio potwierdziło przeprowadzenie zwolnień, nie podając jednak ich skali, i poinformowało o zapewnieniu wsparcia osobom objętym redukcją zatrudnienia.
Filozofia i podejście Media Molecule deklaruje przywiązanie do modelu pracy zakładającego utrzymywanie stosunkowo niewielkiego zespołu przy jednoczesnym tworzeniu gier o jakości porównywanej z produkcjami AAA. Według przedstawicieli studia w siedzibie ma panować nieformalna atmosfera sprzyjająca współpracy, co pozytywnie ocenił m.in. Hideo Kojima podczas wizyty w 2016. Zespół kładzie nacisk na kreatywną swobodę i innowacyjność, co przejawia się m.in. w interaktywnych prezentacjach oraz podejściu do projektowania gier. Studio podkreśla, że jego pracownicy, określani jako „Molecules”, cieszą się dużą elastycznością i swobodą twórczą.