Zęby policzkowe są szerokie, wysokie i prostokątne. Ich guzki językowe uległy redukcji. Drugi z trzonowców jest bardzo niski i kołkowaty.
Występuje wąskie uropatagium, nie porośnięte włosem po stronie brzusznej. Natomiast po stronie grzbietowej rosną na nim włosy, sięgające aż za piszczele. Niekiedy występuje niewielki ogon, niekiedy nie występuje. Ostroga osiąga długość od 7 do 8 mm.
Błony skrzydeł tego gatunku nietoperza są czarne i biegną od boków ciała aż do drugiego palca stopy. Występuje pazur wskaziciela.
Systematyka thumb|left|Bystrolot ciemny należy do rodzaju bystrolot w obrębie plemienia Balionycterini, obejmującego 10 rodzajów, w tym czapecznika (na zdjęciu czapecznik owocożerny) Nowy takson nietoperza opisany został przez Johna Edwarda Graya w 1870 roku pod nazwą Cynopterus marginatus var. nigrescens, czyli jako odmiana barwna Cynopterus marginatus. Jako miejsce typowe podano „Morty Ailand”, co oznaczało wyspę Morotai w obrębie Moluków w Indonezji. Rodzaj Cynopterus określa się dziś po polsku jako krótkonosek.