Na początku 2026 roku grupa mieszkańców skupiona wokół Jana Hoffmana, przewodniczącego rady dzielnicy I Stare Miasto, podjęła inicjatywę przeprowadzenia referendum w sprawie odwołania Miszalskiego oraz Rady Miasta Krakowa. Inicjatorzy zarzucali władzom miasta między innymi narastające zadłużenie, „kolesiostwo”, brak transparentności, niewywiązywanie się z obietnic wyborczych, zły sposób wprowadzenia strefy czystego transportu, podwyżki cen biletów, wydłużenie godzin płatnego parkowania oraz objęcie niedziel opłatami za parkowanie. W zbiórkę podpisów i kampanię referendalną włączyli się także Łukasz Gibała ze stowarzyszeniem Kraków dla Mieszkańców, a także partie Prawo i Sprawiedliwość oraz Konfederacja. Zbiórkę podpisów pod referendum odwoławczym rozpoczęto 27 stycznia. Po 43 dniach inicjatorzy złożyli w krakowskiej delegaturze Krajowego Biura Wyborczego około 134 tys. podpisów przy wymaganym minimum 58 355.