Rozwój kościoła Millar był wikariuszem w parafii Holy Trinity Brompton w latach 1985–2005. Jest on główną osobą odpowiedzialną za stworzenie Kursu Alpha. Jego następcą na stanowisku wikariusza i szefa Kursu Alpha został Nicky Gumbel. W tym okresie opracował on w Londynie strategię zakładania nowych kościołów (ang. church planting), umożliwiając wymierającym wspólnotom odrodzenie dzięki wiernym i duchownym posyłanym z Holy Trinity – wszystko w ścisłej współpracy z londyńskimi biskupami. Zrewitalizowane w ten sposób parafie obejmowały:
1985: St Barnabas' Addison Road, West Kensington 1987: St Mark's Battersea Rise 1989: St Paul's Onslow Square 1994: St Stephen's, Westbourne Park 2000: St Paul's, Hammersmith 2002: St George the Martyr's, Queen Square, Bloomsbury 2005: St Paul's, Shadwell
Jego osiągnięciem jest również przywrócenie do użytku nieczynnego wcześniej kościoła św. Pawła przy Onslow Square, znajdującego się na terenie jego parafii.
Publikacje i nauczanie Millar zainicjował „Kurs Małżeński” oraz „Kurs Przygotowania do Małżeństwa”, które odbywają się zarówno w Wielkiej Brytanii, jak i w wielu innych krajach. W 2005 ukazała się książka będąca zbiorem jego tekstów pt. All I Want Is You.