Mimo kłopotów finansowych odmówił firmowania własnym nazwiskiem opatentowanego specyfiku, choć proponowano mu udział w zyskach.

W ostatnich miesiącach jego sytuacja się poprawiła: Brown został prywatnym lekarzem kilku zamożnych rodzin, a z księgarzem umówił się na pięćset funtów za prawa do przygotowywanego traktatu o podagrze. Zmarł 7 października 1788 roku, dzień po rozpoczęciu kolejnego kursu wykładów, po ataku, który ówczesne relacje określały jako apopleksję. Pochowano go przy kościele St James’s na Piccadilly.