Prace projektowe były nadzorowane przez wydzielone w 1947 r. z Ministerstwa Komunikacji Biuro Elektryfikacji Kolei. Pierwotny projekt SKM, opracowany przez prof. Romana Podoskiego, zakładał wykorzystanie istniejącego od XIX torowiska wspólnego z linią dalekobieżną. Do realizacji zatwierdzono jednak pochodzący sprzed 1914 roku projekt budowy wydzielonego torowiska dla kolei miejskiej na odcinku Gdańsk Główny – Gdynia Główna, którego pierwsze prace ziemno-budowlane rozpoczęły się jeszcze w 1914 roku. Po 1947 roku, wykorzystując już wykonane fragmenty, zrealizowano zmieniony i ostateczny projekt opracowany przez Dyrekcję Okręgową Kolei Państwowych w Gdańsku, zarządzaną przez mgr inż. Zbigniewa Modlińskiego, późniejszego ministra komunikacji.
Lata 50. XX wieku Pierwsza linia Gdańsk Główny – Gdańsk Nowy Port Jako pierwszą oddano do ruchu lokalną linię Gdańsk Główny – Gdańsk Nowy Port. Pomimo braku wykwalifikowanych kadr oraz problemów z zaopatrzeniem w urządzenia niezbędne do eksploatacji trakcji elektrycznej, linię oficjalnie otwarto 2 stycznia 1951 roku. Z powodu problemów, ruch wkrótce zawieszono, po czym kolej ponownie rozpoczęła funkcjonowanie 4 marca 1951 roku. W początkowych miesiącach funkcjonowania linii wykorzystywane były prostowniki odzyskane z okrętów podwodnych.