Według ustaleń Haliny Turskiej nazwa miejscowości wywodzić się ma od właściwości terenu, a oznaczać ona ma miejsce pełne pnikaów lub karczyH. Turska, Nazwy miejscowe powiatu chełmińskiego, [w:] ,,Dzieje Chełmna i jego regionu. Zarys monograficzny", red. M. Biskup, Toruń 1968, s. 102..
Podział administracyjny Na 1570 jest poświadczone, iż stanowiła własność królewską, należała do starostwa lipienieckiego i podlegała pod parafię w Lisewie.
W latach 1975–1998 miejscowość należała administracyjnie do województwa toruńskiego.
Wedle urzędowego podziału terytorialnego kraju, w obrębie Pniewitego wyróżnione są 3 części miejscowości: Klasztor, Nad Torem i SepetySIMC: Klasztor – 1028271, Nad Torem – 1028319, Sepety – 1028472.. Do końca 2010 r. wyróżniona była także 1 dalsza część miejscowości – Nad Jeziorem, jednak została ona zniesiona z dniem 1 stycznia 2011 r.Rozporządzenie Ministra Spraw Wewnętrznych i Administracji z dnia 23 grudnia 2010 r. w sprawie ustalenia, zmiany i zniesienia urzędowych nazw niektórych miejscowości oraz ustalenia nazw obiektów fizjograficznych ()