Pomnik Wyżykowskiego znajduje się w Lubinie w parku nazwanym jego imieniem. Odsłonięty w 1985 monument autorstwa prof. Hanny Jelonek powstał z inicjatywy Towarzystwa Miłośników Ziemi Lubińskiej. W zbiorach Muzeum Miedzi w Legnicy znajduje się rzeźba przedstawiająca Jana Wyżykowskiego autorstwa Zbigniewa Frączkiewicza. Jego postać i zasługi odkrycie upamiętnia także wystawa stała "Miedź. Dzieje niezwykłego metalu".
W Muzeum Regionalnym w Brzozowie znajduje się ekspozycja poświęcona jego życiu i dorobkowi naukowemuJerzy Ferdynand Adamski: Brzozów – przewodnik. Warszawa-Kraków: Wydawnictwo PTTK „Kraj”, 1985. .
Wybrane publikacje 1958 Poszukiwanie rud miedzi na obszarze strefy przedsudeckiej. Przegląd Geologiczny, 1, Warszawa. 1961 Północno-zachodni zasięg krystalinikum przedsudeckiego i możliwości poszukiwań cechsztyńskich rud miedzi w tym rejonie. Prz. Geol. 4, Warszawa. 1963 Najnowsze wyniki badań geologicznych w rejonie Kożuchowa. Prz. Geol. 4, Warszawa. 1964 Utwory czerwonego spągowca na Przedgórzu Sudetów. Prz. Geol. 7/8, Warszawa. 1964 Zagadnienie miedzionośności cechsztynu na tle budowy geologicznej strefy przedsudeckiej. Prace Instytutu Geologicznego. 1967 Kierunki poszukiwań złóż rud miedzi. Prz. Geol. 10, Warszawa. 1971 Cechsztyńska formacja miedzionośna w Polsce. Prz. Geol.