Po II wojnie światowej majątek należący do kapituły katedralnej, liczący 115 ha, nie został rozparcelowany ponieważ dekret o reformie rolnej wyłączał z niej własność kościelną. Po uchwaleniu stawy o przejściu na własność państwa majątków należących do związków wyznaniowych 4 kwietnia 1950 roku majątek kapituły katedralnej został przejęty przez państwo ( z wyłączeniem 5 ha w otoczeniu kaplicy św. Magdaleny) i wydzierżawiony przedsiębiorstwu hodowli roślin w Górce Narodowej. Na mocy ustawy z 17 maja 1989 w 1994 roku Kościołowi zwrócono 50 ha gruntu w Witkowicach, którego właścicielem ( po ustaleniach wewnątrzkościelnych) stało się Wyższe Seminarium Duchowne Archidiecezji Krakowskiej.

Zachowała się pochodząca z 1632 r. przydrożna figura Męki Pańskiej. W 1832 roku polecono dzierżawcom zaniedbaną kapliczkę, która się przewróciła „kosztem włościan w tym samym miejscu postawić”. Zrobiono to rok później co upamiętnia umieszczony na niej napis.

W latach 90. nad doliną Prądnika wzniesiono Osiedle Witkowice Nowe.