W 1916 ożenił się powtórnie, z Heleną Raube (1898–1975).

Ordery i odznaczenia Krzyż Komandorski z Gwiazdą Orderu Odrodzenia Polski (29 stycznia 1946) „w uznaniu zasług położonych w dziedzinie pracy naukowej”. Krzyż Komandorski Orderu Odrodzenia Polski (19 marca 1936) „za zasługi na polu pracy naukowej”.

Nagrody 1900 – Złoty Medal Wystawy Powszechnej w Paryżu za mapy jego autorstwa, 1902 – wielki medal im. Przewalskiego Rosyjskiego Towarzystwa Geograficznego i złoty medal Konstantinowski, 1905 – nagroda Helmersena rosyjskiej Akademii Nauk za prace geologiczne.

Upamiętnienie W 1946 jego imieniem nazwano przylądek na południu wyspy Sachalin i wulkan na wyspie Paramuszyr w grupie Wysp Kurylskich, później lodowiec w Górach Środkowokamczackich oraz miejscowość w zachodniej Syberii, na wschód od Jekaterynburga.

W 1978 minerałowi o wzorze chemicznym AgBiSe2 nadano nazwę bohdanowiczyt.

Przypisy