Historia Wczesne koncepcje BW ukazywały Transformerów w podobnej, gigantycznej postaci co w poprzedniej serii. Jednak Forward i DiTillio zdecydowali się na inny pomysł: akcja rozgrywać się będzie na prehistorycznej Ziemi na długo zanim rozbiła się na niej „Arka”. DiTillio ujawnił, że decyzja o tym nie została podjęta przed końcem pierwszego sezonu. Dano planecie dwa Księżyce i zdecydowano, że jeden z nich zostanie zniszczony, jeśli zdecydują się na motyw z Ziemią.
Planowano, by BW rozgrywało się w obecnych czasach, lecz pomysł zarzucono. Jedyną pozostałością jest to, że G1 i BW rozgrywają się w tym samym wszechświecie.
Wczesne koncepty mówiły, że dowódcy Maximali i Predaconów (Primal i Megatron) mają być wcieleniami oryginalnych dowódców, Prime'a i Megatrona (Galvatrona), lecz później wyszło na jaw, że to oddzielne charaktery (każdy z nich stanął twarzą w twarz z oryginalnymi dowódcami pod koniec sezonu drugiego). Prawdopodobnie pomysł ten zarzucono wraz z ideą aby BW rozgrywało się w nowożytności.