W latach 1914–1915 seminarium zamknięto, a budynek zamieniono na szpital wojskowy. Budynek został zdewastowany, a wyposażenie, kaplica i biblioteka zostały rozgrabione. Podczas II wojny światowej bp Franciszek Barda przeniósł seminarium do willi „Anatolówka” w Brzozowie, które w 1946 roku powróciło do Przemyśla. Z powodu znacznego wzrostu powołań konieczna stała się dalsza rozbudowa i w 1984 roku rozpoczęto budowę gmachu dydaktycznego, który w 1988 roku poświęcił bp Ignacy Tokarczuk w 300-lecie istnienia seminarium.
Rektorzy Rektorzy seminarium w Przemyślu.
Rektorzy seminarium w Brzozowie (1763–1783)ks. Jan Rąb Dom księży Misjonarzy i Seminarium Diecezjalne w Brzozowie 1760–1783 (str. 19-29) [dostęp 2019-05-11]. 1763–1769. ks. Jakub Gierkowicz. 1769–1774. ks. Daniel Bogdanowicz. 1774– ?. ks. Antoni Staniszewski. 1777?–1780. ks. Michał Domaradzki. 1780–1783. ks. Wawrzyniec Krzemkowski.
Władze seminarium rektor – ks. dr Maciej Dżugan dyrektor administracyjny – ks. mgr lic. Grzegorz Urban ojciec duchowny – ks. dr Piotr Stefański ojciec duchowny – ks. mgr lic. Maciej Ruszel prefekt – ks. dr Kamil Szpilka prefekt etapu propedeutycznego - ks. dr Łukasz Jastrzębski
Absolwenci