Struktura udziałów spółki była następująca: 326 udziałów (98,79%) – Skarb Państwa reprezentowany przez Wojewodę Zielonogórskiego, 2 udziały (0,61%) – duńskie przedsiębiorstwo Antodele, spółka córka kolei Danske Statsbaner, 1 udział (0,30%) – samorząd gminy Jasień, 1 udział (0,30%) – samorząd gminy Sulechów.
W wyniku negocjacji prowadzonych przez PKP, zarząd LKR i władze województwa wytypowano linie kolejowe do przekazania nowemu przewoźnikowi. 4 marca 1992 ostatecznie określono obszar działania spółki, na który składało się 277 km linii. Wojewodzie Zielonogórskiemu na rzecz LKR przekazano odcinki: Toporów – Sieniawa Lubuska, Sulechów – Świebodzin (zamknięty ze względu na zły stan techniczny), Sulechów – Konotop (zamknięty ze względu na zły stan techniczny), Sulechów – Wolsztyn, Wolsztyn – Nowa Sól (najlepszy stan techniczny wśród przekazanych odcinków), Kożuchów – Niegosławice, Stary Raduszec – Lubsko i Lubsko – Tuplice (zamknięty ze względu na zły stan techniczny), Lipinka Głogowska – Kolsko.