Tymczasem na powierzchni wojska radzieckie bez większych problemów zajmują miasto. Armia Stanów Zjednoczonych poddaje się bez walki wobec groźby ataku atomowego przy pomocy głowic umieszczonych na Kubie oraz okrętach podwodnych, które otaczają całe wybrzeże Ameryki. Rząd, wraz z prezydentem, zostaje aresztowany i oskarżony o zbrodnie przeciwko ludzkości. Wolne media zastępuje propagandowa stacja telewizyjna. Armia Czerwona przekształca każdy nadający się do tego budynek w posterunek wojskowy. Od tej pory gracz kieruje poczynaniami Chrisa, który przystępuje do ruchu oporu.
Rozgrywka Freedom Fighters jest grą z gatunku strzelanek trzecioosobowych, w której gracz porusza się po ulicach Nowego Jorku, walcząc z siłami Armii Czerwonej. Wraz z każdym wykonanym zadaniem oraz pobocznymi elementami, jak choćby pomoc rannym cywilom, gracz zyskuje charyzmę. Im wyższy jest jej poziom, tym więcej ludzi można przyłączyć do drużyny.