Przebieg konklawe Konklawe rozpoczęło się późnym wieczorem 14 czerwca w pałacu na Kwirynale i trwało zaledwie dwa dni. W tym czasie odbyły się cztery głosowania. Najwięcej głosów w poszczególnych turach (po zsumowaniu głosów w fazie skrutynium i akcesu) uzyskiwali:
15 czerwca rano: Lambruschini – 15; Mastai-Ferretti – 13
15 czerwca wieczorem: Mastai-Ferretti – 17; Lambruschini – 13
16 czerwca rano: Mastai-Ferretti – 27; Lambruschini – 11
16 czerwca wieczorem: Mastai-Ferretti – 36; Lambruschini – 10
W wieczornym głosowaniu 16 czerwca 1846 Giovanni Maria Mastai-Ferretti w fazie akcesu uzyskał zatem wymaganą większość głosów i został wybrany na papieża, przyjmując imię Pius IX, na cześć Piusa VII. Z uwagi na późną porę, dopiero następnego dnia rano protodiakon Tommaso Riario Sforza wygłosił do Rzymian formułę Habemus papam. Tak szybki wybór „liberała” Mastai-Ferrettiego przez konserwatywne w większości Święte Kolegium był sporym zaskoczeniem dla opinii publicznej, która skądinąd przyjęła go bardzo entuzjastycznie. 21 czerwca odbyła się uroczysta inauguracja pontyfikatu.
Wyniki głosowań