W maju 2016 było ich 49.
Uruchomiono sklep internetowy Alma24.pl, wprowadzono markę własną Krakowski Kredens i program lojalnościowy Klub Konesera.
Bankructwo Pomiędzy lipcem a wrześniem 2016 roku w mediach pojawiło się wiele informacji o kłopotach Almy. Według dziennikarzy Piotra Mączyńskiego i Leszka Kostrzewskiego Alma przegrała walkę na rynku z sieciami dotychczas uchodzącymi za dyskonty, zwłaszcza Biedronkę i Lidla, które zaczęły kilka lat wcześniej wprowadzać do swojej oferty towary luksusowe, a jej problemy pogłębił podatek handlowy. Autorzy wskazali także podobieństwo dużych przecen towarów w Almie w styczniu 2015 roku z przecenami ze stycznia 2011 w delikatesach Bomi, które upadły w latach 2012–2013, jako ważny symptom problemów sieci.
Alma Market w czwartek 15 września 2016 roku złożyła do krakowskiego sądu wniosek o otwarcie postępowania sanacyjnego. 19 września, po wydaniu oficjalnego oświadczenia o postępowaniu i skorygowaniu tegorocznych prognoz przychodów z 900 mln do zaledwie 660 mln złotych (spadek o ok. 26%), kurs akcji spółki spadł pomiędzy otwarciem giełdy a godz. 14:00 o 12,5%.