W październiku 2016 poinformowano, że program lojalnościowy Almy Klub Konesera zostanie zakończony z dniem 2 grudnia 2016 roku. 27 października 2016 sklep internetowy Alma24.pl został zamknięty. Od września 2016 sklepy fizyczne także były stopniowo zamykane. Na początku grudnia 2016 sieć liczyła już tylko 10 placówek.
15 listopada z fotelu prezesa został odwołany Jerzy Mazgaj, który pozostał w spółce jako szef rady nadzorczej.
13 lutego 2017 roku Alma zgłosiła wniosek o upadłość likwidacyjną.
28 marca spółka opublikowała raport za rok 2016 ze stratą wynosząca 234 mln zł, która to strata była większa niż suma zysków z całej historii funkcjonowania spółki. Przychód w tamtym roku wyniósł ponad miliard złotych. 7 kwietnia PKO BP i Benus złożyli uproszczone wnioski o ogłoszenie upadłości Alma Market.
21 listopada 2017 roku Sąd Rejonowy dla Krakowa-Śródmieścia w Krakowie, VIII Wydział Gospodarczy do spraw upadłościowych i restrukturyzacyjnych wydał postanowienie o ogłoszeniu upadłości Alma Market Spółki Akcyjnej oraz zatwierdzeniu warunków sprzedaży zorganizowanej części przedsiębiorstwa określając cenę sprzedaży na kwotę 94 mln zł netto dla Immomok Sp. z o.o. w Warszawie (podmiot, który prowadzi market E.Leclerc na warszawskim Ursynowie)