Dialog z Watykanem dał Bractwu korzyści w postaci: 1 września 2015 uznania spowiedzi na czas trwania Roku Miłosierdzia (okres ten przedłużono 21 listopada 2016 na czas nieokreślony), uznania święceń kapłańskich kleryków FSSPX bez zgody miejscowych biskupów (co wcześniej było wymagane), a od 4 kwietnia 2017 nadano prawo księżom bractwa do udzielania ślubów. 3 czerwca 2015 Kongregacja Nauki Wiary pozwoliła bp. Fellayowi jako przełożonemu na wydawanie kar kanonicznych. Z kolei dobre relacje Bractwa pozwoliły na unormowanie jego działalności na terenie niektórych krajów, np. Argentyny gdzie zaczęli współpracować z pozostałymi kapłanami.
Mimo polepszania się statusu Bractwa oraz przyjaznych relacji, bp. Fellay nie szczędził nieraz papieżowi Franciszkowi słów krytyki względem jego samego oraz Kościoła. Będąc obecnym na marszu życia w Waszyngtonie 28 stycznia 2016, przełożony Bractwa św. Piusa X skrytykował postanowienia ostatniego synodu, jednocześnie wyraził zupełne niezrozumienie wobec zachowania papieża.