329.
W 1934 roku rozpoczął się spór Gendena ze Stalinem. Na jednym ze spotkań radziecki przywódca naciskał na Gendena, aby ten zniszczył kler buddyjski poprzez eksterminację lamówBaabar, B., History of Mongolia, 1999, , OCLC 515691746. s. 34. Genden stanowczo się temu sprzeciwił, ponieważ sam był praktykującym buddystą (kiedyś stwierdził „na ziemi znajdują się dwaj wielcy geniusze – Lenin i Budda”). Genden zapowiedział, że nie będzie walczył z religią i pozwolił lamom na dowolne głoszenie swoich poglądówBaabar, B., History of Mongolia, 1999, , OCLC 515691746. s. 322. Genden działał także na rzecz zakończenia stacjonowania wojsk radzieckich w Mongolii. Próbował przełożyć w czasie zawarcie dwustronnej umowy, w której ZSRR obiecało Mongolii ochronę w przypadku inwazji oraz Traktatu o Przyjaźni i Współpracy. Politykę ZSRR określał jako „czerwony imperializm”. Premier próbował wykorzystać napięcia na linii ZSRR-Japonia na korzyść Mongolii i uwolnienia się spod dominacji radzieckiej. Polityka ta doprowadziła do upadku Gendena, gdy w 1936 roku został oskarżony o współpracę z JaponiąBaabar, B., History of Mongolia, 1999, , OCLC 515691746. s. 349. Już pod koniec 1935 roku Genden został wezwany do Moskwy, gdzie Stalin skarcił go za niestosowanie się do jego wytycznych.