W rozgrywkach o puchar UEFA także zbyt wiele nie zwojowali, gdyż ich przygoda zakończyła się za sprawą niemieckiego zespołu Kaiserslautern na drugiej rundzie. Kolejny sezon 1992/93 już w zreformowanej lidze (Sheffield Wednesday było jednym z założycieli Premier League) drużyna zakończyła na 7 pozycji. W tym samym roku ponownie dotarli do finału rozgrywek pucharowych. 15 maja 1993 roku na Wembley spotkali się w finale FA Cup z Arsenalem. Po remisie (1:1) i braku wyłonienia zwycięzcy w pierwszym finałowym spotkaniu doszło do ponownego rozegrania meczu w dniu 20 maja. Tym razem po dogrywce mecz zakończył się wygraną Arsenalu, 2:1.
Od sezonu 1993/94 (7 miejsce) do sezonu 1999/2000 Sheffeld Wednesday uczestniczyło w rozgrywkach Premier League. Najwyższe 7 miejsce osiągnęli w sezonach 1993/94 oraz 1996/97. W międzyczasie uczestniczyli w rozgrywkach o puchar UEFA Intertoto (sezon 1995/96), który zakończyli na fazie grupowej. W sezonie 1999/2000 Sheffeld Wednesday po zdobyciu 31 punktów i zajęciu 19 pozycji, spadł do Division One i jak na razie nie udało mu się powrócić do najwyższej klasy rozgrywkowej.