Zawodnik wrócił do Chorwacji, ale nie jak to zwykle bywało do zespołu NK Rijeki, tylko do trzecioligowej drużyny NK Pomorac Kostrena, w której występował od sezonu 2005/2006. Wtedy jednak nie awansowali z 3 do 2 ligi, bowiem w poprzednim sezonie drużyna z Kosterny zajęła 8. miejsce w lidze. Milinović występował w drużynie w sezonie 2006/2007, a po zakończeniu sezonu, latem 2007 roku Milinović definitywnie zakończył piłkarską karierę a kilka miesięcy później objął stanowisko menedżera NK Pomorac Kosterna.
Kariera reprezentacyjna W reprezentacji Chorwacji Milinović zaliczył debiut 12 czerwca 1997 w rozgrywanym w Sendai meczu w ramach towarzyskiego turnieju Kirin Cup przeciwko Turcji. Chorwaci zremisowali ten mecz 1:1. Ostatni, czwarty, jak do tej pory występ Damira Milinovicia w reprezentacji to rozgrywany 28 kwietnia 1999 mecz z Włochami zremisowany przez Chorwatów 0:0.
1. 12 czerwca 1997, Sendai, Turcja – Chorwacja 1:1 2. 10 lutego 1999, Split, Chorwacja – Dania 0:1 3. 10 marca 1999, Ateny, Grecja – Chorwacja 3:2 4.