Po wybuchu II wojny światowej był bliskim współpracownikiem generała Władysława Sikorskiego. Został jednym z trzech wiceprezesów Rady Narodowej Rzeczypospolitej Polskiej, emigracyjnego parlamentu polskiego, utworzonego w Paryżu. W czerwcu 1940 przedostał się po kapitulacji Francji do Londynu. Od 3 września do 20 października 1941 był ministrem sprawiedliwości w trzecim rządzie Władysława Sikorskiego.
Był zdecydowanym przeciwnikiem żydowskich ugrupowań narodowych, opowiadał się konsekwentnie za asymilacją Żydów.
Zmarł w wyniku udaru mózgu w Londynie 21 października 1941 i pochowany został w części wschodniej cmentarza Highgate (Highgate East, Sq. 84, gr. 50563). Jego symboliczny grób znajduje się na cmentarzu żydowskim w Przemyślu. Pośmiertnie odznaczony Orderem Orła Białego postanowieniem prezydenta RP Władysława Raczkiewicza z 21 października 1941.
Upamiętnienie thumb|Symboliczny grób Hermana Liebermana na nowym cmentarzu żydowskim w Przemyślu W filmie Śmierć prezydenta (1977) w reżyserii Jerzego Kawalerowicza w rolę Hermana Liebermana wcielił się aktor Kazimierz Iwor.