Pod koniec życia napisał wiele tekstów wspomnieniowych i opracowań historycznych dotyczących udziału w konspiracji, zwłaszcza w organizacji Zachód i Biurze Informacji i Propagandy KG AK. Zmarł 30 września 1984, pochowano go w rodzinnym grobie na cmentarzu w Kórniku.
Życie prywatne W 1929 ożenił się z Julią Kapczyńską, z którą mieli dwoje dzieci: Bogusławę (ur. 1931) i Zygmunta (młodszy). Ich córka, Bogusława Michałowska-Kowalska, była plastykiem i projektowała meble (razem ze swoim mężem Czesławem Kowalskim), a także zajmowała się architekturą wnętrz i malarstwem. Wnuk Stanisława, Jacek Kowalski, jest historykiem sztuki (wykładowcą Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu) oraz poetą, pieśniarzem i tłumaczem literatury starofrancuskiej.
Upamiętnienie W 2005 r. w Wielkopolskim Muzeum Niepodległości w Poznaniu zaprezentowano wystawę dotyczącą jego losów pt. Od Kórnika do Moskwy. Stanisław Michałowski – polityk, społecznik i żołnierz.
W Kórniku znajduje się ulica Stanisława Michałowskiego.
W Grudziądzu 25 września 2018 r.