Życie prywatne 17 sierpnia 1997 ożenił się z Francescą Tomasi, z którą ma troje dzieci: dwie córki – Calii Tee (ur. 13 czerwca 1998) i Marcellę Francescę (ur. 17 stycznia 2002) oraz syna – Castora Virgila (ur. 18 maja 2000). W 2001 roku rozpoczął terapię odwykową z powodu choroby alkoholowej, co zostało pokazane w filmie Some Kind of Monster. Pod koniec września 2019 r. Hetfield ponownie trafił na odwyk. Z tego powodu Metallica odwołała trasę koncertową po Australii i Nowej Zelandii, która miała odbyć się w listopadzie tegoż roku.
W 2008 roku, odnosząc się do wykorzystania muzyki Metalliki do torturowania irackich więźniów, Hetfield nie był urażony i powiedział: „Jeśli Irakijczycy nie są przyzwyczajeni do wolności, to cieszę się na bycie częścią ich wprowadzenia w nią.” (ang. If the Iraqis aren't used to freedom, then I’m glad to be part of their exposure.). W wywiadzie z 2017 roku Hetfield potwierdził swoje wcześniejsze stanowisko, mówiąc: „Jestem zaszczycony, że mój kraj korzysta z czegoś dla naszego bezpieczeństwa, o ile to robią. Ale z drugiej strony, nie mam na to wpływu, jak muzyka zostanie już wypuszczona. Tak samo, jak ktoś rozdaje ją w Internecie. Wykorzystują ją, aby robić to, co robią.” (ang. I’m honored my country is using something to help us stay safe, if they are.