Termalica Bruk-Bet Nieciecza 4 lipca 2011 roku Nowak podpisał dwuletni kontrakt z Termalicą Bruk-Bet Nieciecza. Nowak zadebiutował w barwach nowego klubu 22 lipca 2011 roku w wygranym 1:0 meczu z GKS-em Katowice w ramach rozgrywek I ligi. W czerwcu 2013 roku przedłużył umowę z niecieczańskim klubem. 8 września 2013 roku zadebiutował w roli kapitana w wygranym 1:0 meczu z GKS-em Bełchatów w ramach rozgrywek I ligi. W sezonie 2015/16 rozegrał 24 spotkania w których strzelił 1 bramkę. Łącznie w Termalice rozegrał 82 spotkania.
GKS Katowice 10 czerwca 2016 roku podpisał dwuletnią umowę z GKS Katowice.
Kariera reprezentacyjna W 2006 roku Nowak wystąpił w reprezentacji Śląska w towarzyskim, charytatywnym meczu z reprezentacją Polski.
Gol 25 kwietnia 2016 roku Sebastian Nowak strzelił głową gola w doliczonym czasie gry po rzucie rożnym wykonywanym przez Dawida Plizgę w wyjazdowym spotkaniu Termaliki przeciwko Wiśle Kraków (2:2), dając tym samym drużynie z Niecieczy remis.