Dyrekcja W lutym 2009 dyrektorem Muzeum Narodowego został prof. Piotr Piotrowski, a od 28 października 2010 funkcję tę sprawowała dr Agnieszka Morawińska. Od 30 listopada 2018 do 2 grudnia 2019 dyrektorem muzeum był prof. Jerzy Miziołek. Piotr Gliński powołał na jego miejsce dra hab. Łukasza Gawła, który pełnił tę funkcję do 2 lutego 2024, kiedy został odwołany przez Bartłomieja Sienkiewicza. Od lutego 2024 p.o. dyrektora była historyczka sztuki, Agnieszka Rosales Rodríguez, a 28 stycznia 2025 roku w wyniku konkursu została powołana na dyrektorkę Muzeum.
Zbiory Sztuki Starożytnej thumb|Figura Amona, 18 Dynastia (między 1333 – 1323 p.n.e.) thumb|Dionizos siedzący na koźle, okres hellenistyczny, II wiek p.n.e thumb|Portret chłopca z Fajum, autor nieznany, II w. thumb|Malowidła z katedry w Faras na wystawie, widok w kierunku absydy
Utworzone w 1938 roku. Ich podstawę stanowił depozyt Uniwersytetu im. J. Piłsudskiego w Warszawie, który obejmował wiele zabytków egipskich odkrytych przez badaczy w Edfu pod kierownictwem K. Michałowskiego.