W 1997 poślubił nauczycielkę szkoły podstawowej Caroline Fentress. Mają dwie córki Lily Ann (ur. 1999) i Maeve Frances (ur. 2007) oraz trzech synów – Christophera Eugene’a Jr. (ur. 2000), Charlesa McHugh (ur. 2003) i Finleya (ur. 2006). Zamieszkali w Chicago.
Filmografia Filmy fabularne Rok Tytuł Rola Reżyser 1990 Mężczyźni nie odchodzą (Men Don’t Leave) Chris Macauley Paul Brickman 1991 Smażone zielone pomidory (Fried Green Tomatoes) Buddy Threadgoode Jon Avnet 1992 Więzy przyjaźni (School Ties) Chris Reece Robert Mandel Zapach kobiety (Scent of a Woman) Charlie Simms Martin Brest 1993 Trzej muszkieterowie (The Three Musketeers) D’Artagnan Stephen Herek 1994 Błękit nieba (Blue Sky) Glenn Johnson Tony Richardson 1995 W kręgu przyjaciół (Circle of Friends) Jack Foley Pat O’Connor Szalona miłość (Mad Love) Matt Leland Antonia BirdBatman Forever Dick Grayson/Robin Joel Schumacher 1996 Komora (The Chamber) Adam Hall James Foley Miłość i wojna (In Love and War) Ernest ‘Ernie’ Hemingway Richard Attenborough 1997 Batman i Robin (Batman & Robin) Dick Grayson/Robin Joel Schumacher 1999 Kto zabił ciotkę Cookie?