Kilka miesięcy później zakres jego kompetencji poszerzono o sprawy związane z Millennium Dome.
W 1998 Mandelson został członkiem gabinetu jako minister handlu i przemysłu. Na tym dał się poznać jako zwolennik współpracy ze związkami zawodowymi. W ministerstwie rządził tylko przez kilka miesięcy. Pod koniec roku, w związku z dymisją Rona Daviesa, były laburzystowski deputowany Matthew Parris, publicznie określił Mandelsona jako homoseksualistę„Mandelson is gay, says former MP”, The Mirror (1998-10-28), str. 3.. Mandelson nigdy nie krył się ze swoją orientacją seksualną"Openly gay minister Peter Mandelson caught up in latest expenses scandal", Pink News (2009-05-08), dostęp 2009-10-04 , ale nie chciał na ten temat dyskutować. Po wypowiedzi Parrisa rozgorzała jednak debata na temat życia osobistego ministra. Sytuację Mandelsona pogorszyła jeszcze decyzja jego doradcy politycznej, Anne Sloman, aby cenzurować wszystkie wypowiedzi dotyczące ministra na antenie BBC.