Arjan Beqaj (ur. 25 sierpnia 1975 w Prizrenie) – piłkarz albański grający na pozycji bramkarza.

Kariera klubowa Beqaj urodził się w Prizrenie, jest jednak wychowankiem klubu ze stolicy Albanii, Tirany. Do Partizani Tirana trafił jeszcze w wieku kilkunastu lat, a w pierwszej lidze zadebiutował w wieku 20 lat w 1995. W pierwszym sezonie nie był jeszcze podstawowym zawodnikiem zespołu, ale do pierwszego składu wdarł się już w sezonie 1995/1996. Natomiast w 1997 roku osiągnął swój jedyny sukces w ojczyźnie, jakim było zdobycie Pucharu Albanii.

Latem 1997 Beqaj wyjechał do Grecji i został zawodnikiem OFI Kreta. Miejsce między słupkami bramki klubu z Iraklionu zyskał w sezonie 1998/1999, jednak klub był jedynie ligowym średniakiem i nie walczył o mistrzostwo Grecji. W sezonie 2001/2002 Beqaj nie miał już tak pewnego miejsca w składzie kreteńskiego zespołu jak wcześniej i walczył o nie z dawnym reprezentantem Grecji Kostasem Chaniotakisem. W OFI grał do lata 2003 i wtedy przeniósł się do AO Ionikos.