Rodzaj wari zalicza się – obok czterech innych współczesnych rodzajów – do rodziny lemurowatych. Pozostałe to: prolemur, maki, lemur i lemuria. Rodzaj lemur w przeszłości obejmował również dzisiejsze wari, aczkolwiek w 1978 von Hagen przeniósł je do innej rodziny – indrisowatych, obejmującej sifaki, indrisa i awahi. Rzeczona propozycja nie spotkała się z dużym uznaniem. W 1994 roku Macedonia i Stanger uznali wari za klad siostrzany kladu obejmującego lemurowate (w dzisiejszym rozumieniu pozostałe lemurowate) i indrisowate, opierając się na badaniach komunikacji. Jeszcze dalej poszła Stanger-Hall w 1997 roku, w ogóle wyłączając wari z Lemuroidea. Późniejsi autorzy nie wsparli i tego pomysłu, wracając do klasyfikacji wari w rodzinie lemurowatych, w odrębnym rodzaju. Przez dłuższy czas był doń zaliczany pojedynczy gatunek, dzielony na dwa podgatunki. Później uznano każdy z nich za osobny gatunek; drugim prócz wari czarno-białego przedstawicielem tego rodzaju jest wari rudy.
Kolorystyka V. variegata jest niezwykle zmienna;