Gracz może kierować pojedynczym najemnikiem lub całą grupą, wydawać im rozkazy przemieszczania się, interakcji z NPC oraz obiektami napotkanymi w sektorze. Najemnicy mogą biec, iść, czołgać się, pływać oraz kroczyć w pozycji przykucniętejJagged Alliance 2 instrukcja, s. 17.. Ponadto mogą oni wspinać się na płaskie dachy.
Walka Gra przechodzi w tryb walki, kiedy w zasięgu wzroku najemników gracza bądź wroga znajdzie się przeciwnik. Możliwe jest to także wtedy, gdy przyjazny bądź neutralnie nastawiony NPC zostanie sprowokowany lub zaatakowany. Możliwe są walki zarówno dniem jak i nocą.
Królowa Deidranna dysponuje trzema rodzajami wojsk: regularną armią, jednostkami elitarnymi oraz czołgami. Jednostki elitarne pojawiają się wraz z postępami gracza, czołgi wspierają wojska obronne w Medunie i na jej peryferiach.