Okres zdjęciowy Barw ochronnych trwał 20 dni. Film kręcono w pośpiechu w ośrodku wypoczynkowym w Rozalinie pod Warszawą, a Różewicz i Zanussi mieli wątpliwości, czy dialog „dwóch facetów, którzy chodzą i gadają”, nie nadaje się bardziej do telewizji aniżeli do kina. Odgrywający rolę Szelestowskiego Zbigniew Zapasiewicz łączył udział w zdjęciach z intensywną pracą w Teatrze Dramatycznym, gdzie przygotowywał premierę Kubusia Fatalisty i jego pana Denisa Diderota. Po latach aktor wspominał: „Jeździłem tam [do ośrodka w Rozalinie] po próbie w teatrze i często wracałem na spektakl, czasem dojeżdżałem na plan na dwie godziny. Wszystko było gotowe; co się dało, było zrobione na dublerze [...] Byłem wtedy w niezłej formie, przyjeżdżałem już przygotowany i ciach, tak z lewej ręki to zrobiłem. Bardzo ciekawe doświadczenie: coś niepoprzedzone przygotowaniami, rozmyślaniami, tylko takie wejście na strzał”.