Ruch Chorzów 19 września 2013 podpisał 2-letni kontrakt z Ruchem Chorzów zastępując na tym stanowisku Jacka Zielińskiego, który to podał się do dymisji po sromotnej porażce jaką ponieśli chorzowianie w Białymstoku, gdzie miejscowa Jagiellonia 15 września 2013 roku rozbiła Ruch 6:0. Z drużyną z Chorzowa w sezonie 2013/14 Ján Kocian wywalczył III miejsce w Ekstraklasie premiowane występami w Lidze Europy UEFA, w której to doprowadził chorzowian do Rundy play-off, w której Ruch odpadł po dwumeczu (0:0, 0:1) z ukraińskim Metalistem Charków. Wcześniej w III rundzie kwalifikacyjnej do Ligi Europy UEFA pod wodzą Słowaka po pięknym dwumeczu (0:0, 2:2) chorzowianie wyeliminowali duński Esbjerg fB oraz w II rundzie kwalifikacyjnej FC Vaduz z Liechtensteinu. Niestety w rundzie jesiennej sezonu 2014/15 w Ekstraklasie drużyna zaczęła grać poniżej oczekiwań, czego ukoronowaniem było odpadniecie chorzowian w 1/16 Pucharu Polski z III-ligowcem Ostrovią 1909 Ostrów Wielkopolski (1:2). Po 11 kolejkach ligowych chorzowianie zajmowali zaledwie 14. miejsce w tabeli z dorobkiem 8 punktów. Legło to u podstaw wersji oficjalnej do zwolnienia Słowaka z funkcji trenera Ruchu, z którym to pożegnał się 6 października 2014.