Kariera trenerska Po zakończeniu kariery piłkarskiej Kocian został trenerem. W latach 1993–1995 był asystentem Jozefa Vengloša, selekcjonera nowo powstałej wówczas reprezentacji Słowacji. W 1996 roku został pierwszym trenerem Dukli Bańska Bystrzyca i zajął z nią 5. miejsce w pierwszej lidze słowackiej. W sezonie 1997/1998 prowadził czeską Petrę Drnovice, z którą zakończył sezon na 9. miejscu w tabeli, a w sezonie 1998/1999 – 1. FC Košice (4. miejsce w lidze). W latach 1999–2002 Kocian był asystentem Ewalda Lienena w 1. FC Köln, a w latach 2002–2004 Willi Reimanna w Eintrachcie Frankfurt. Następnie samodzielnie bez sukcesów prowadził drużyny z 2. Bundesligi, Rot-Weiss Erfurt i Sportfreunde Siegen. 3 listopada 2006 został selekcjonerem reprezentacji Słowacji zastępując na tym stanowisku Dušana Galisa. Pracował tam do 2008 roku, a od lata 2008 do 2009 roku był asystentem Karela Brücknera w reprezentacji Austrii.