W 2006 r. na linii Shinkansen eksploatowanej przez JR Tōkai 2,7%, a na sieci JR Higashi Nihon aż 8,5% pasażero-km wykonane zostało przez pasażerów posiadających bilety miesięczne. O ile pierwsza liczba odnosi się również do regionów zurbanizowanych Keihanshin i Nagoi, o tyle druga liczba obejmuje w większości ruch w okręgu tokijskim.

Zespoły piętrowe „MAX” (typu E4) zostały wprowadzone z myślą o zwiększeniu pojemności linii dla pomieszczenia dojeżdżających do pracy. Na Jōetsu i Tōhoku Shinkansen specjalnie dla nich wprowadzono pociągi krótkodystansowe (Nasuno do stacji 郡山 Kōriyama – 1 para na godz. i Tanigawa do stacji 越後湯沢 Echigo-Yuzawa – 1-2 pary na godz.). Na Tōkaidō Shinkansen ruchowi codziennemu służą głównie pociągi Kodama, zatrzymujące się na wszystkich stacjach (2 pary na godz.).

Koleje prywatne thumb|Pociąg ekspresowy na linii aglomeracyjnej. Funabashi. Skyliner kolei Keisei (do Lotniska Narita) na stacji 京成船橋 Keisei-Funabashi thumb|Machida/Jokohama. Zajezdnia 長津田 Nagatsuta na linii 田園都市線 Den’entoshi kolei Tokyū thumb|Linia czterotorowa na wiadukcie w strefie gęstej zabudowy. Tokio – linia Ikebukuro-sen kolei Seibu koło stacji Nerima;