Baptysterium jest pomieszczeniem na planie wydłużonego prostokąta o wymiarach 7x3 m, nakrytym drewnianym stropem. Całą szerokość jednej z krótszych ścian (zachodniej) zajmuje kamienny basen, nad którym wznosi się przyścienna aedicula wsparta na dwóch kolumnach i dwóch pilastrach. Basen od wewnątrz ma wymiary: 1,62 m (długość) x 1 m (szerokość) x 0,95 m (głębokość). Prawdopodobnie chrzczono w nim poprzez zanurzenie. Aedicula jest polichromowana – dekoracja kolumn naśladuje spiralnie skręcone (tordowane) trzony, łuk zdobiony jest rozetą, dwiema gałązkami i winnymi gronami, na błękitnym sklepieniu baldachimu wymalowane są gwiazdy, a na ścianie (do której dostawiona jest konstrukcja) przedstawiono wizerunek Dobrego Pasterza ze stadem owiec wraz z Adamem i Ewą u stóp.
Na pozostałych ścianach zachowała się około połowa malowideł. Są one rozmieszczone w dwóch pasach – górnym z tłem białym i dolnym z tłem ciemnym. Wyżej namalowano kolejne sceny z niewielkimi postaciami ukazującymi cuda Jezusa i odnoszącymi się do zbawienia. Zachowała się scena uzdrowienia paralityka i wyobrażenie apostoła Piotra chodzącego po wodzie.