Pytanie o ich pochodzenie jest motywem często powtarzającym się w serialu.
Bohaterowie – narrator i główny bohater serii, licealista, który jest wyluzowany i pełen sarkazmu. Jego prawdziwe imię nie jest wyjawione; wszyscy wołają na niego Kyon, co jest przezwiskiem nadanym mu przez jego młodszą siostrę. Jest jedynym zwykłym człowiekiem w brygadzie SOS. Akcja serialu opowiadana jest z jego perspektywy.
– tytułowa bohaterka, przewodnicząca Brygady SOS. Jest energetyczna, kocha przygody i wykorzystuje pozostałych członków klubu do zapewnienia sobie rozrywki. Nie potrafi znieść nudy. Ma zdolność do zmieniania rzeczywistości według własnego upodobania, jednak ona sama nie jest tego świadoma.
– cicha miłośniczka książek, która stroni od nawiązywania kontaktu z innymi. W rzeczywistości jest „humanoidalnym interfejsem”, bądź sztucznym człowiekiem, stworzonym przez pozaziemską cywilizację zwaną Jednostką Integracji Danych.
– nieśmiała drugoklasistka, która tak naprawdę jest podróżnikiem w czasie.
– zawsze się uśmiecha i zawsze jest więcej niż chętny do zaspokajania dziwnych potrzeb Haruhi.