W grudniu 1999 roku pod naciskiem opinii publicznej Tadeusz Popiel zrezygnował z prezesury Towarzystwa na rzecz Janusza Gieruckiego, etnografa i muzealnika. Stację przekazano wraz z całą infrastrukturą Katowickiemu Stowarzyszeniu Milośników Kolei. Dokonano reorganizacji stacji. Postanowiono stopniowo odbudować zdewastowany szlak Gliwice-Rudy-Racibórz. Udało się usunąć krzaki i naprawić część szlaku. Wyremontowano część lokomotyw.
Lokalni działacze oskarżają Stowarzyszenie o zezłomowanie części starego wyposażenia stacji, która mogła stać się eksponatami muzealnymi. Trudno jednak zweryfikować podstawność tego zarzutu. Rozebrano także linię teletechniczną biegnącej wzdłuż szlaku, co jest również oceniane negatywnie przez miłośników kolei.
W styczniu 2009 roku obiekt został przejęty przez gminę Kuźnia Raciborska. Naczelnikiem stacji Rudy został Jarosław Łuszcz, który starał się o zwiększenie i odbudowę taboru i remontowanie szlaków. Dzięki jego działaniom kolejka wąskotorowa w Rudach została znacznie spopularyzowana, a na szlaku odbywa się stały ruch turystyczny.