W 2005 roku celem klubu był powrót do pierwszej ligi, jednak trener Leo Grozavu preferował zbyt defensywną taktykę, co przyniosło wiele bezbramkowych remisów. Z tego powodu, choć w ostatnich meczach klub wygrał 4:0 z liderem ligi (Liberty Salonta), potem 4:0 na wyjeździe z trzecią drużyną w tabeli (Gaz Metan Mediaș) i 3:2 (prowadząc 3:0) z wiceliderem (Bihor Oradea), nie udało się zająć drugiego, premiowanego awansem miejsca. Ostatecznie na koniec sezonu 2005/06 Universitatea zajęła 3. miejsce tracąc 1 punkt do drugiego w tabeli klubu Bihor.
Na początku sezonu 2006/07 klub zmienił trenera – nowym szkoleniowcem został Adrian Falub. Jako piłkarz rozegrał on w Universitatea Cluj 220 meczów pierwszoligowych, jednak jako trener nigdy nie prowadził jeszcze żadnego zespołu. Pod jego kierownictwem drużyna początkowo spisywała się słabo, osiągając nawet 8 pozycję. Wkrótce jednak słaby okres minął i zespół szbko osiągnął 1. miejsce, zdobywając nawet 6 punktową przewagę nad wiceliderem. Na trzy tygodnie przed końcem sezonu, 19 maja 2007, klub zremisował 0:0 z drugim w tabeli Dacia Mioveni i uzyskał awans do pierwszej ligi. Ośmioletni okres gry w niższych ligach dobiegł końca.
Zawodnicy
Trenerzy